Cives Mundi es una organización financieramente sólida e independiente gracias al alto porcentaje de recursos propios y a la diversificación de sus fuentes de financiación pública que, en los últimos años, han provenido de más de 40 administraciones e instituciones diferentes.

La transparencia en la gestión de sus recursos es un principio fundamental para Cives Mundi. Por ello, cada año una empresa externa realiza una auditoría de sus cuentas y su informe está a disposición de todo el mundo en la página web de la ONGD.